清华附中的科技教育坚持为创新人才成长奠基，既要兼容并包，又要彰显个性。为了达成为创新人才成长奠基的目标，清华附中设计实施进阶式的课程体系，包括基础性课程、创客类课程和高研类课程，组织开展大量高影响力的教育活动，同时和清华、北大、中科院等科研机构及腾讯等高科技公司建立了良好的合作伙伴关系，聘请知名学者及优秀校友作为学生导师，为中学生上课，指导学生项目。清华附中在硬件上也投入巨大，于2013年成立创客空间，2015年与全美排名第一的科技高中托马斯·杰斐逊科技高中合作成立高研实验室。