4月28日，2012-2013中国初高中篮球联赛第三阶段的比赛——男子高中（男高）、男子初中（男初）、女子高中（女高）三个组别的挑战赛在清华附中篮球馆举行。作为主场的清华附中男高、男初、女高三个篮球队均获得胜利，挺进全国总决赛。这是有史以来首次同一所学校的三个组同时赢得挑战赛。
当日上午，首先举行男子初中组挑战赛，对阵双方是清华附中对四川宜宾八中，主场作战的清华附中男初队员，克服心理障碍，最终以74∶48获胜，率先挺进全国总决赛。随后举行女子高中组挑战赛，清华附中对阵江苏金陵中学，清华附中女高队以74∶42获得决赛权。当日下午举行的男子高中组挑战赛，清华附中对阵浙江回浦中学，上半场比分始终胶着，比赛过程跌宕起伏，以31∶31双方战平；比赛进入下半场，双方不时调整技战术，随着一记超远三分，清华附中锁定胜局，以79∶67战胜浙江回浦，再次挺近全国总决赛。
2012-2013中国初高中篮球联赛全国总决赛将在5月份正式打响，最终决出本届联赛全国总冠军。
